اين واكسن بي خطر و موثر است و عوارض جانبي كمي دارد.
شايع ترين عوارض جانبي درد، قرمزي و تورم در محل تزريق و گاهي تب، سردرد يا درد عضلاني است، اين عوارض معمولاً خفيف هستند و در عرض چندروز از بين مي روند.
موارد منع مصرف واكسن آنفلوانزا:
شيرخواران با سن كمتر از ۶ماه
 افراد داراي سابقه واكنشهاي آلرژيك شديد نظير آنافيلاكسي به واكسن آنفلوانزا و يا هريك از اجزاي واكسن تا يك روز پس از واكسيناسيو
در گروه‌هاي زير واكسن آنفلوانزا بايد با احتياط و با تجويز و تحت نظر پزشك مصرف شود:
افراد داراي حساسيت شديد به تخم مرغ، بروز كهير شديد، تغييرات قلبي عروقي و افت فشارخون، ديسترس تنفسي، بروز علايم گوارشي
 واكنش‌هاي نيازمند دريافت اپي نفرين يا مداخلات اورژانسي طبي بعنوان واكنش‌هاي آلرژيك شديد يا حساسيت شديد تعريف مي شوند(اين افراد بايد با نظر پزشك اقدام به دريافت واكسن نمايند و پس از دريافت واكسن بمدت نيم ساعت تحت نظرپزشك قرار داشته باشند.)
 افرادي كه داراي سابقه آلرژي خفيف به تخم مرغ مي باشند فقط خارش و كهير خفيف ميتوانند واكسن آنفلوانزا را دريافت نمايند.
 توصيه مي شود اين افراد بعد از دريافت واكسن به‌مدت حداقل ۱۱ دقيقه در حالت نشسته يا خوابيده به پشت تحت نظر قرار گيرند.
افراد داراي سابقه بيماري گيلن باره در طي ۶هفته پس از دريافت واكسن آنفلوانزاي قبلي
در افراد داراي بيماري حاد متوسط يا شديد با يا بدون تب واكسيناسيون تا زمان بهبودي حال عمومي به تعويق مي افتد.
در حال حاضر افراد مشكوك يا مبتلا به بيماري كوويد- 19 تا زمان رفع علايم
بيماري) حداقل۲هفته ( مجاز به دريافت واكسن آنفلوانزا نمي باشند.
انديكاسيون هاي موارد مصرف و موارد منع واكسيناسيون آنفلوانزا در اين گروه همانند افراد فوق الذكر مي باشد.
افراد در معرض تماس با افراد مثبت از نظر كوويد و افرادي كه در قرنطينه يا ايزولاسيون ناشي از بيماري كوويد مي باشند، پس از اتمام مدت زمان (قرنطينه/ ايزولاسيون) حداقل دو هفته و به شرط نداشتن علائمي به نفع بيماري كوويد مي توانند واكسن آنفلوانزا را دريافت نمايند.